นับแต่ครั้งสมเด็จพระอริยวงศาคตญาณสมเด็จพระสังฆราช (ปุ่น ปุณณสิริ) ได้ก่อตั้งโรงเรียนแพทย์แผนโบราณขึ้นเมื่อปี พ.ศ. ๒๔๙๘ เพื่อเป็นศูนย์กลางแห่งการเรียนรู้ด้านการแพทย์แผนโบราณ ทั้งวิชาเภสัชกรรม, เวชกรรม และการผดุงครรภ์ไทย จวบจนโรงเรียนฯได้เริ่มเปิดสอนวิชาการนวดแผนโบราณ ตามกระแสรับสั่งของพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว ที่ทรงถามกับคณะครูว่า "โรงเรียนมีการสอนนวดด้วย หรือไม่" ในปี พ.ศ. ๒๕๐๕ ทำให้เป็นโรงเรียนแห่งแรกที่มีการสอนวิชาแพทย์แผนโบราณครบทั้ง ๔ สาขา จนถึงปัจจุบัน